代表论文（一作/通讯）
1. Wu, P., Z. Wang, A. Bhatnagar, P. Jeyakumar, H. Wang, Y. Wang and X. Li (2021). Microorganisms-carbonaceous materials immobilized complexes: Synthesis, adaptability and environmental applications. Journal of Hazardous Materials 416: 125915.
（正式定义了微生物-炭基搭载体系McMIC，系统总结了目前McMIC的制备、性能和未来研究热点）
2. Zheng, X., S. Yang, L. Chen, R. N. Kimotho, M. Chen, J. Chen, J. Zhang and X. Li (2021). A newly-isolated Cd-loving Purpureocillium sp. strain YZ1 substantially alleviates Cd toxicity to wheat. Plant and Soil. DOI：https://doi.org/10.1007/s11104-021-04954-5
（发现一株喜镉真菌，该真菌有良好的镉耐受性状，能显著降低小麦镉吸收，相关专利微生物肥料专利已经提交）
3. Yang, S., W. Feng, S. Wang, L. Chen, X. Zheng, X. Li and D. Zhou (2021). Farmland heavy metals can migrate to deep soil at a regional scale: A case study on a wastewater-irrigated area in China. Environmental Pollution 281: 116977.
（通过区域尺度和深层土壤采样，发现污灌可以导致大面积小麦和深层土壤的污染）
4. Li, X. F., M. M. Islam, L. Chen, L. K. Wang and X. Zheng (2020). Metagenomics-Guided Discovery of Potential Bacterial Metallothionein Genes from the Soil Microbiome That Confer Cu and/or Cd Resistance. Applied and Environmental Microbiology 86(9).
（发展了一套功能宏基因组学方法，可以大规模回避筛选压力来挖掘环境DNA的重金属抗性基因，这一方法是基于序列的宏基因组学的一个重要进展，AEM当期spotlights文章）
5. Xing, C., J. H. Chen, X. Zheng, L. Chen, M. M. Chen, L. K. Wang and X. F. Li (2020). Functional metagenomic exploration identifies novel prokaryotic copper resistance genes from the soil microbiome. Metallomics 12(3): 387-395.
（通过功能宏基因组学方法，挖掘到土壤微生物组中大量新颖铜抗性基因，这些完全不同于传统已知抗性决定因子的基因，为系统生物学角度进一步探索微生物重金属抗性提供了起始和基因材料）
6. 李小方 (2020). 重金属污染农田安全利用:目标,可选技术与可推广技术. 中国生态农业学报 028(006): 860-866.
（通过回溯土壤污染治理决策树和安全利用概念历史、建立镉迁移模型，系统分析了安全利用技术体系的可推广性，并提出了未来安全利用技术评价标准）
7. Wang, L. K. and X. F. Li (2019). Steering soil microbiome to enhance soil system resilience. Critical Reviews in Microbiology 45(5-6): 743-753.
（将土壤针对污染物的自我清除能力纳入了以病原菌抑制能力为核心的土壤免疫概念）
8. Li, X. F. (2019). Technical solutions for the safe utilization of heavy metal-contaminated farmland in China: A critical review. Land Degradation & Development 30(15): 1773-1784.
（分析了中国重金属污染农田安全利用的必要性，基于对已有田试成果总结，提出了安全利用技术方案的可推广性问题，并提出低镉小麦-根际钝化-叶面调控为核心的生物技术方案）
9. Li, X. (2019). Metagenomic screening of microbiomes identifies pathogen-enriched environments. Environmental Sciences Europe 31(1): 37.
10. Li, X. F. and D. M. Zhou (2019). A Meta-Analysis on Phenotypic Variation in Cadmium Accumulation of Rice and Wheat: Implications for Food Cadmium Risk Control. Pedosphere 29(5): 545-553.
（建立了世界低镉作物数据库，以该大数据为基础统计分析了水稻和小麦的镉转移和富集系数特征，反演了适合中国土壤标准的水稻和小麦镉转移系数阈值，并预测安全土壤中也有相当一部分品种可以生产超标籽粒，建议根部到地上部的镉转移环节为基因工程的关键性状）
11. Zheng X, Chen L, Chen M, et al. Functional Metagenomics to Mine Soil Microbiome for Novel Cadmium Resistance Genetic Determinants. Pedosphere, 2019, 29( 3):298-310.
（通过功能宏基因组学方法，挖掘到土壤微生物组中大量新颖镉抗性基因）
12. CHEN, Miaomiao, ZHENG, et al.. Cadmium-Resistant Oyster Mushrooms from North China for Mycoremediation. Pedosphere, 2018.
（收集了华北平原主要平菇品种，通过毒理学测试统计了其镉抗性阈值分布，发现了两株超抗性菌株）
13. LI Xiaofang, Bond P L , Huang L . Diversity of As Metabolism Functional Genes in Pb-Zn Mine Tailings. Pedosphere, 2017, 27(003):630-637.
14. Islam M , Karim M , Zheng X , et al. Heavy Metal and Metalloid Pollution of Soil, Water and Foods in Bangladesh: A Critical Review[J]. International Journal of Environmental Research & Public Health, 2018, 15(12).
（统计分析了Bangladesh全国尺度的重金属污染热点区域）
15. Jinghao, Chen, Chao, et al. Functional Genomic Identification of Cadmium Resistance Genes from a High GC Clone Library by Coupling the Sanger and PacBio Sequencing Strategies.[J]. Genes, 2019, 11(1).
（在研究高GC克隆子库的构建和测序过程中，我们遇到了如何对长序列进行高通量测序的问题，该论文报导的方法可以高通量、低成本对高GC克隆子库进行测序分析）
16. Chen, M.; Wang, L.; Hou, J.; Yang, S.; Zheng, X.; Chen, L.; Li, X. Mycoextraction: Rapid Cadmium Removal by Macrofungi-Based Technology from Alkaline Soil. Minerals 2018;8:589
（通过工程设计找到了适合大型真菌进行土壤重金属萃取的办法，现有实验技术体系镉年理论提取效率已经与东南景天接近）
17. Li, X.F.; You, F.; Bond, P.L.; Huang, L.B. Establishing microbial diversity and functions in weathered and neutral Cu-Pb-Zn tailings with native soil addition. Geoderma 2015;247:108-116
（基于铅锌尾矿成土修复理念，探索了模拟天然土壤组分设计的复合添加技术能否恢复铅锌尾矿土壤多样性和功能）
18. Li, X.F.; Huang, L.B. Toward a New Paradigm for Tailings Phytostabilization-Nature of the Substrates, Amendment Options, and Anthropogenic Pedogenesis. Critical Reviews in Environmental Science and Technology 2015;45:813-839
（建立了世界尾矿性质数据库，基于尾矿性质、风化机理、土壤发生理论和世界土壤chronosequence的主要发展规律，重新定义铅锌铜尾矿是新颖成土母质，不能使用传统土壤修复技术进行复垦，系统评估了现有添加剂效果并提出人工成土的概念和技术路线）
19. Li, X.F.; Bond, P.L.; Van Nostrand, J.D.; Zhou, J.Z.; Huang, L.B. From lithotroph- to organotroph-dominant: directional shift of microbial community in sulphidic tailings during phytostabilization. Scientific Reports 2015;5:12978
20. Li, X.F.; Park, J.H.; Edraki, M.; Baumgartl, T. Understanding the salinity issue of coal mine spoils in the context of salt cycle. Environmental Geochemistry and Health 2014;36:453-465
21. Li, X.F.; Huang, L.B.; Bond, P.L.; Lu, Y.; Vink, S. Bacterial diversity in response to direct revegetation in the Pb-Zn-Cu tailings under subtropical and semi-arid conditions. Ecological Engineering 2014;68:233-240
（该论文报导了世界上第一个针对高盐碱、高重金属尾矿样品的微生物多样性研究，改进了土壤DNA提取技术并成功富集到了尾矿DNA）
22. Li, X.F.; Sun, J.W.; Huang, Y.Z.; Ma, Y.B.; Zhu, Y.G. Copper Toxicity Thresholds in Chinese Soils Based on Substrate-Induced Nitrification Assay. Environmental Toxicology and Chemistry 2010;29:294-300
23. Li, X.F.; Zhu, Y.G.; Cavagnaro, T.R.; Chen, M.M.; Sun, J.W.; Chen, X.P.; Qiao, M. Do ammonia-oxidizing archaea respond to soil Cu contamination similarly asammonia-oxidizing bacteria? Plant and Soil 2009;324:209-217
（在氨氧化古菌发现不久，我们使用铜作为抑制剂，发现了氨氧化古菌一样可以对铜胁迫响应，并且抗性要强于细菌，为氨氧化古菌在土壤中的活性提供了间接证据，研究中揭示了活性-群落丰度相关性为氨氧化过程作为重金属测试indicator提供了机理基础）
1. 国家自然科学基金面上项目，41877414，功能宏基因组学方法表征环境样品镉抗性基因多样性，2019.01-2022.12，56万，在研，主持
2. 土壤重金属污染生物修复技术，2019.1-2021.12，200万，在研，主持
3. 国家重点研发计划项目，2018YFD0800306，雄安新区农田面源和重金属污染综合防治技术集成示范，2018.7-2020.12，63万（总课题318万），在研，课题主持
4. 河北省杰出青年基金，D2018503005，重金属污染农田安全利用：小麦-微生物低吸收体系，2018.1-2020.12，30万，在研，主持
5. 365英国上市官网水资源重点实验室培育项目，Y826012605，唐河污水库重金属垂向迁移风险评估，2018.1-2019.12， 20万，在研，主持
6. Y726012203，重金属污染农田安全利用技术，2017.1-2018.12，80万，结题，主持
7. UQ Postdoctoral Research Fund， Biodiversity of microbial community structure in the continuum of tailings landscape，2012.4-2015.12，A$306,000，结题，主持
8. UQ Early Career Researcher Fund， Are fungi pioneers in the colonization of microbial community in base metal mine tailings? 2012.1-2012.12，A$35,000，结题，主持
9. Rare metals Jamaica Limited (RMJL)，Developing options and strategies for red mud bioremediation at Rodinia Resources Pty Ltd，2015.7-2016.3，5万澳元，结题，主要申请人
10. UQ Collaboration and Industry Engagement Fund，Phosphorus Use Efficiency in Sugarcane Genotypes，2011.1-2011.12，6.3万澳元，结题，主要申请人
11. UQ-UWA Bilateral Research Collaboration Award，Engineering biochars for restoring and sustaining soil-plant systems – From mined land to crop fields，2011.1-2012.12，1万澳元，结题，参与人
12. UQ-UWA Bilateral Research Collaboration Award， Rehabilitation in hostile environments: identifying transitional states in the below-ground ecology of mine tailings and residues under revegetation，1.6万澳元，结题，参与人
